Генетические исследования

Что такое генетические исследования и какую информацию они дают врачу

Генетические исследования (ДНК-тесты, генотипирование) — это лабораторные методы, которые анализируют структуру ДНК (дезоксирибонуклеиновой кислоты) человека для выявления наследственных мутаций, предрасположенности к заболеваниям, фармакогенетических маркёров (как организм реагирует на лекарства), а также для установления родства. В отличие от рутинной биохимии или гормонов, которые показывают текущее состояние (здесь и сейчас), генетика показывает генетический «чертёж», заложенный при рождении и неизменный в течение жизни.

Материал для исследования: венозная кровь (5–9 мл в пробирку с ЭДТА), буккальный эпителий (соскоб с внутренней стороны щеки), слюна (некоторые тесты), реже — амниотическая жидкость (при пренатальной диагностике). Для стандартных генетических панелей достаточно слюны или мазка изо рта (безболезненно).

Типы генетических тестов:

• Носительство моногенных заболеваний: мутации, вызывающие определённую болезнь (например, муковисцидоз, фенилкетонурия, спинальная мышечная атрофия). Если у человека есть одна копия мутации (носитель), он не болен, но может передать её детям.

• Предрасположенность к многофакторным заболеваниям: диабет 2 типа, сердечно-сосудистые, аутоиммунные. Оцениваются однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), повышающие или понижающие риск.

• Фармакогенетика: как организм метаболизирует лекарства (например, варфарин, клопидогрел, статины). Позволяет подобрать дозу индивидуально, избегая токсичности.

• Онкогенетика: мутации в генах BRCA1, BRCA2 (риск рака молочной железы, яичников), Lynch-синдром (рак толстой кишки) и другие.

• Нутригенетика: предрасположенность к дефициту витаминов, реакция на кофеин, лактозу, глютен.

Анализ проводится методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) в реальном времени, секвенирования (Sanger, NGS — массовое параллельное секвенирование). Сроки выполнения от 3 до 30 дней в зависимости от сложности и количества генов.

В каких ситуациях и кому назначают генетические исследования

Ситуация 1: Планирование беременности (прегравидарная подготовка). Оба партнёра сдают тест на носительство наиболее частых моногенных заболеваний (муковисцидоз, спинальная мышечная атрофия, фенилкетонурия, адреногенитальный синдром). Если оба — носители одной и той же мутации, риск рождения больного ребёнка 25%. Риск: без теста можно не знать о носительстве и родить ребёнка с тяжёлым наследственным заболеванием.

Ситуация 2: Семейная предрасположенность к раку. Если у кровных родственников (мать, сестра, дочь) был рак молочной железы или яичников до 50 лет, или несколько случаев рака в семье (отец, брат с раком простаты или поджелудочной), показано тестирование на мутации BRCA1, BRCA2, а также гены Lynch-синдрома. Риск: носители имеют 50–80% риск рака молочной железы и 20–40% рака яичников. Раннее выявление позволяет проводить профилактику (мастэктомию, овариэктомию) или более частое скрининговое обследование.

Ситуация 3: Непереносимость лекарств (статус метаболизма через CYP450). Если стандартная доза варфарина (разжижает кровь) у вас вызывает кровотечения или, наоборот, не работает, возможно, у вас «медленный» метаболизм через CYP2C9. Генетический тест позволяет подобрать безопасную дозу. Аналогично для клопидогрела (CYP2C19), амитриптилина (CYP2D6). Риск: стандартные дозы некоторых препаратов у медленных метаболизаторов токсичны, а у быстрых — неэффективны.

Ситуация 4: Диагностика редких наследственных болезней у ребёнка или взрослого при неясной клинической картине. Если у ребёнка задержка развития, судороги, необычные черты лица, но стандартные анализы ничего не дают, назначают экзомное секвенирование (анализ всех генов, кодирующих белки). Риск: без генетики диагноз может остаться неясным, а лечение будет симптоматическим, тогда как при некоторых болезнях есть специфическая терапия.

Ситуация 5: Желание оценить свои генетические риски для коррекции образа жизни (нутригенетика). Например, у вас есть полиморфизм в гене MTHFR, связанный с дефицитом фолиевой кислоты, или в гене FTO (предрасположенность к ожирению), или в генах лактазы (непереносимость лактозы). Риск: не зная этих особенностей, вы можете следовать общим диетическим рекомендациям, которые для вас неоптимальны (например, пить молоко при непереносимости лактазы).

Ситуация 6: Установление отцовства, родства, идентификация личности. ДНК-тест со сравнением 16–21 маркеров (STR-локусов) даёт точность до 99,999999%. Применяется в судах, для восстановления документов.

Как проходит сдача биоматериала для генетических исследований

Пошаговый алгоритм

1. Консультация генетика (рекомендована, но не обязательна для прямых потребительских тестов). Врач объясняет, какие мутации имеет смысл искать и какие последствия могут быть.

2. Запись в лабораторию, имеющую аккредитацию по молекулярно-генетическим методам.

3. Сбор биоматериала. Варианты:

• Венозная кровь (5–9 мл в пробирку с ЭДТА или цитратом). Используется для полногеномного секвенирования или когда нужна высокая концентрация ДНК.

• Буккальный мазок (соскоб со щеки) — безболезненно: специальной палочкой с ёршиком проводят по внутренней стороне щеки 10–20 раз. Делают 2 мазка (правая и левая щека). Популярно для тестов на носительство, фармакогенетику.

• Слюна — в стерильную пробирку собирают 2 мл слюны (не петь, не есть за 30 минут).

• Образец ногтей или волос — редко, для тестов на родство.

4. Оформление информированного согласия — генетические данные особо чувствительны, лаборатория обязана объяснить, как будет использоваться материал.

5. Ожидание результатов — от 3 до 30 рабочих дней.

Какие документы взять с собой

• Паспорт.

• Направление врача-генетика (очень желательно) — с указанием предполагаемого синдрома или группы генов.

• Предыдущие генетические результаты (если есть).

• Семейную родословную (если известна) — врач-генетик может помочь её собрать.

Что именно оценивают в образце: ключевые мутации и гены

Для прегравидарного скрининга (носительство):

• CFTR: муковисцидоз (частота 1:30–1:50 в европейской популяции).

• SMN1: спинальная мышечная атрофия.

• PAH: фенилкетонурия.

• CYP21A2: адреногенитальный синдром.

• HBB: бета-талассемия.

Онкогенетика:

• BRCA1, BRCA2: риск рака молочной железы (до 80%), яичников (до 40%), простаты, поджелудочной железы.

• MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 (Lynch-синдром): риск рака толстой кишки (до 80%), эндометрия, яичников, желудка.

• APC: семейный аденоматозный полипоз (тысячи полипов в толстой кишке, риск рака 100%).

• RET: медуллярный рак щитовидной железы.

Фармакогенетика:

• CYP2C9 и VKORC1: доза варфарина.

• CYP2C19: метаболизм клопидогрела.

• CYP2D6: метаболизм многих антидепрессантов, кодеина.

• SLCO1B1: риск токсичности статинов (миопатия).

• HLA-B*5701: риск гиперчувствительности к абакавиру (лекарство от ВИЧ).

Нутригенетика (часто в коммерческих панелях):

• MTHFR: дефицит фолиевой кислоты, риск гипергомоцистеинемии.

• LCT (MCM6): непереносимость лактозы.

• HLA-DQ2/DQ8: предрасположенность к целиакии (глютеновой энтеропатии).

• FTO: предрасположенность к ожирению.

Скорость выполнения и готовность результатов

• Базовое носительство (5–10 генов): 3–5 дней.

• Экзомное секвенирование (все кодирующие гены): 15–30 дней.

• Полногеномное секвенирование (вся ДНК, включая некодирующие области): 30–60 дней.

• BRCA1/2 (по Сэнгеру): 7–14 дней.

• Фармакогенетические тесты (CYP450): 3–7 дней.

• Установление отцовства: 7–14 дней.

Как правильно подготовиться к генетическому анализу

1. Специальной подготовки не требуется. Гены не меняются в зависимости от того, поел ты или нет, выпил или не выпил. Единственное: перед взятием буккального мазка не ешьте и не пейте за 30 минут (кроме воды), не чистите зубы, не пользуйтесь ополаскивателем — чтобы удалить лишние бактерии и частицы пищи.

2. Сообщите о переливании крови. Если вам переливали кровь менее чем за 3 месяца до генетического теста, в образце может быть ДНК донора. Тест может дать ложный результат. Отложите тест или используйте буккальный мазок (там ДНК донора не будет).

3. Для теста на отцовство — добровольное информированное согласие всех участников (если ребёнку менее 18 лет — согласие обоих родителей или опекунов).

4. Отмена лекарств не требуется (кроме тестов на метаболизм лекарств — тогда продолжайте принимать как обычно, чтобы оценить «родной» статус).

Бланк результата генетического исследования

Структура бланка

Бланк содержит:

• ФИО, дата рождения, номер заказа.

• Ген: название (например, BRCA1).

• Мутация: точное описание, например, «с.5266dupC (5382insC) в гетерозиготном состоянии».

• Интерпретация: «Выявлена мутация, ассоциированная с повышенным риском рака молочной железы». Или: «Мутаций не выявлено».

• Заключение врача-генетика (в сложных тестах).

• Подпись, печать.

Важно: в отличие от биохимии, здесь нет референсных значений в виде цифр. Есть «норма» (нет мутации) или «мутация». Промежуточных значений не бывает (кроме вариантов неясного клинического значения — VUS, которые требуют уточнения).

В каком виде выдаётся результат

Бумажный сертификат (с подписью и печатью) — для предоставления в роддом, онкодиспансер, суд. PDF на email. Личный кабинет. Для тестов на родство — юридически значимый документ с аккредитацией лаборатории.

Нужны ли подпись и печать

Для предоставления в государственные учреждения (ЗАГС, суд, онкодиспансер, роддом) — обязательны. Для самопознания (коммерческая нутригенетика) — достаточно PDF.

Срок действия результатов

Генетический статус не меняется в течение жизни, поэтому результат действителен навсегда. Не нужно пересдавать тест на те же мутации через год. Исключение — когда появились новые данные о клинической значимости ранее найденного варианта VUS (вариант неясного значения) — тогда через 2–3 года лаборатория может пересмотреть классификацию.

Пройти генетические исследования в Москве

«А-Я Клиника» сотрудничает с аккредитованной молекулярно-генетической лабораторией (ISO 15189). Мы предлагаем: тест на носительство моногенных болезней (20+ болезней) — от 15 000 руб., панель BRCA1/2 — 12 000 руб., фармакогенетика (CYP2C9, VKORC1, CYP2C19, CYP2D6) — 8000 руб., нутригенетическая панель (30+ маркеров) — 25 000 руб., установление отцовства — 12 000 руб. Забор крови или буккального мазка — в клинике (удобно, быстро). Консультация врача-генетика перед тестом — 3000 руб. (рекомендована). Результат в личном кабинете (PDF) и на бумаге. Запись онлайн.

Часто задаваемые вопросы

Вопрос: Можно ли провести генетический тест без направления врача?
Да, для многих коммерческих тестов (нутригенетика, предрасположенность к фитнесу, происхождение) направление не нужно. Для тестов на носительство при планировании беременности и онкогенетики лучше сначала сходить к генетику, чтобы он объяснил последствия (психологический аспект).

Вопрос: Опасно ли знать о мутации BRCA? Не приведёт ли это к депрессии?
Это серьёзный вопрос. Знание о высокой предрасположенности к раку может вызвать тревогу, но даёт шанс на профилактику (ранняя диагностика, профилактические операции). Генетик всегда проводит психологическое консультирование до и после теста. Если вы не готовы к такому знанию, лучше не начинать.

Вопрос: Может ли ребёнок унаследовать мутацию, если у родителей её нет?
Если оба родителя — здоровые не-носители (нет ни одной мутации в гене), то ребёнок не может получить моногенную болезнь (аутосомно-рецессивную). Но возможны новые (de novo) мутации — это редко, но случается, особенно при некоторых генетических синдромах (например, синдром Ушера).

Вопрос: Как долго хранятся образцы ДНК в лаборатории?
По закону — до 3 лет (для возможного пересмотра данных или повторного анализа). Некоторые лаборатории могут хранить дольше по запросу клиента. Вы имеете право потребовать уничтожения образца после получения результата.

Вопрос: Может ли генетический тест предсказать точную дату смерти или болезнь с 100% вероятностью?
Нет. Для моногенных болезней (например, болезнь Гентингтона) — вероятность 100% (если мутация есть, болезнь разовьётся, но возраст начала может варьировать). Для многофакторных заболеваний (диабет, рак) — это только повышение или понижение риска, но не приговор. Многие люди с мутацией BRCA проживают жизнь без рака благодаря профилактике или везению.